Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PSME1Q06323 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PSME1Q06323 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PSME1Q06323 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PSME1Q06323 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PSME1Q06323 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PSME1Q06323 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PSME1Q06323 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PSME1Q06323 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PSME1Q06323 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PSME1Q06323 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PSME1Q06323 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms