Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNP2Q05952 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNP2Q05952 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms