Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CALD1Q05682 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CALD1Q05682 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CALD1Q05682 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CALD1Q05682 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms