Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF11Q05519 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF11Q05519 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF11Q05519 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms