Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD164Q04900 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD164Q04900 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD164Q04900 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD164Q04900 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD164Q04900 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD164Q04900 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CD164Q04900 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD164Q04900 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD164Q04900 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD164Q04900 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CD164Q04900 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD164Q04900 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD164Q04900 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD164Q04900 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD164Q04900 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD164Q04900 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD164Q04900 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD164Q04900 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD164Q04900 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD164Q04900 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD164Q04900 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD164Q04900 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD164Q04900 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD164Q04900 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD164Q04900 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD164Q04900 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD164Q04900 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD164Q04900 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD164Q04900 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD164Q04900 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD164Q04900 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD164Q04900 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD164Q04900 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD164Q04900 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CD164Q04900 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD164Q04900 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD164Q04900 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD164Q04900 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD164Q04900 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD164Q04900 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD164Q04900 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD164Q04900 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD164Q04900 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD164Q04900 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD164Q04900 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD164Q04900 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD164Q04900 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD164Q04900 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD164Q04900 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD164Q04900 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD164Q04900 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD164Q04900 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD164Q04900 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD164Q04900 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CD164Q04900 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CD164Q04900 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD164Q04900 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD164Q04900 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD164Q04900 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD164Q04900 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CD164Q04900 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD164Q04900 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CD164Q04900 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD164Q04900 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD164Q04900 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD164Q04900 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD164Q04900 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD164Q04900 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD164Q04900 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CD164Q04900 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD164Q04900 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD164Q04900 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD164Q04900 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD164Q04900 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD164Q04900 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD164Q04900 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD164Q04900 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD164Q04900 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD164Q04900 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD164Q04900 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD164Q04900 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD164Q04900 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD164Q04900 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD164Q04900 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CD164Q04900 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms