Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SSBP1Q04837 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SSBP1Q04837 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms