Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT17Q04695 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT17Q04695 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms