Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OC90Q02509 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OC90Q02509 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OC90Q02509 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OC90Q02509 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OC90Q02509 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
OC90Q02509 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OC90Q02509 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OC90Q02509 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
OC90Q02509 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OC90Q02509 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OC90Q02509 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OC90Q02509 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OC90Q02509 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OC90Q02509 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OC90Q02509 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OC90Q02509 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
OC90Q02509 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OC90Q02509 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OC90Q02509 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OC90Q02509 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
OC90Q02509 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
OC90Q02509 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OC90Q02509 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OC90Q02509 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OC90Q02509 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OC90Q02509 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OC90Q02509 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OC90Q02509 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OC90Q02509 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OC90Q02509 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OC90Q02509 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OC90Q02509 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OC90Q02509 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OC90Q02509 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OC90Q02509 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OC90Q02509 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OC90Q02509 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OC90Q02509 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OC90Q02509 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OC90Q02509 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OC90Q02509 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OC90Q02509 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OC90Q02509 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OC90Q02509 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OC90Q02509 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OC90Q02509 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OC90Q02509 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OC90Q02509 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
OC90Q02509 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OC90Q02509 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OC90Q02509 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OC90Q02509 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OC90Q02509 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OC90Q02509 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OC90Q02509 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
OC90Q02509 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OC90Q02509 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OC90Q02509 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OC90Q02509 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OC90Q02509 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OC90Q02509 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
OC90Q02509 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OC90Q02509 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OC90Q02509 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OC90Q02509 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OC90Q02509 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OC90Q02509 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OC90Q02509 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OC90Q02509 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
OC90Q02509 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OC90Q02509 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OC90Q02509 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OC90Q02509 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OC90Q02509 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OC90Q02509 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OC90Q02509 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OC90Q02509 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OC90Q02509 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OC90Q02509 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OC90Q02509 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OC90Q02509 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OC90Q02509 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OC90Q02509 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OC90Q02509 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OC90Q02509 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OC90Q02509 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OC90Q02509 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OC90Q02509 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OC90Q02509 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OC90Q02509 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OC90Q02509 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OC90Q02509 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OC90Q02509 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OC90Q02509 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OC90Q02509 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OC90Q02509 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OC90Q02509 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OC90Q02509 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OC90Q02509 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms