Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF9Q00978 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IRF9Q00978 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF9Q00978 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms