Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL1Q00532 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms