Protein–RNA interactions for Protein: P82663

MRPS25, 28S ribosomal protein S25, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS25P82663 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPS25P82663 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPS25P82663 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS25P82663 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS25P82663 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS25P82663 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS25P82663 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS25P82663 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS25P82663 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPS25P82663 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPS25P82663 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPS25P82663 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MRPS25P82663 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS25P82663 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms