Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX1P78414 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX1P78414 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX1P78414 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX1P78414 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX1P78414 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX1P78414 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX1P78414 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX1P78414 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX1P78414 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX1P78414 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX1P78414 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX1P78414 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX1P78414 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX1P78414 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX1P78414 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX1P78414 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX1P78414 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX1P78414 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX1P78414 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX1P78414 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX1P78414 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX1P78414 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX1P78414 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX1P78414 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX1P78414 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX1P78414 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX1P78414 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX1P78414 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX1P78414 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX1P78414 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX1P78414 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX1P78414 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX1P78414 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX1P78414 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX1P78414 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX1P78414 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX1P78414 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX1P78414 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX1P78414 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX1P78414 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX1P78414 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX1P78414 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX1P78414 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX1P78414 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX1P78414 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX1P78414 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX1P78414 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX1P78414 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX1P78414 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX1P78414 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX1P78414 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX1P78414 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX1P78414 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX1P78414 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX1P78414 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX1P78414 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX1P78414 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX1P78414 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX1P78414 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX1P78414 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRX1P78414 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX1P78414 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX1P78414 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX1P78414 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX1P78414 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX1P78414 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX1P78414 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX1P78414 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX1P78414 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX1P78414 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX1P78414 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRX1P78414 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX1P78414 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX1P78414 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX1P78414 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX1P78414 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX1P78414 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX1P78414 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX1P78414 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX1P78414 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX1P78414 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRX1P78414 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX1P78414 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX1P78414 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX1P78414 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX1P78414 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX1P78414 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX1P78414 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX1P78414 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX1P78414 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX1P78414 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX1P78414 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX1P78414 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX1P78414 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX1P78414 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX1P78414 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX1P78414 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX1P78414 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX1P78414 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms