Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBE2L3P68036 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE2L3P68036 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms