Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTG1P63261 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACTG1P63261 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms