Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNRPNP63162 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPNP63162 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNRPNP63162 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1751.4 ms