Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVK-24P63145 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVK-24P63145 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVK-24P63145 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVK-24P63145 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVK-24P63145 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVK-24P63145 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVK-24P63145 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVK-24P63145 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVK-24P63145 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVK-24P63145 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-24P63145 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-24P63145 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms