Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS28P62857 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS28P62857 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS28P62857 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS28P62857 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS28P62857 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS28P62857 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS28P62857 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS28P62857 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPS28P62857 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS28P62857 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS28P62857 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS28P62857 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS28P62857 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS28P62857 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS28P62857 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS28P62857 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS28P62857 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS28P62857 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS28P62857 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS28P62857 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS28P62857 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS28P62857 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPS28P62857 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS28P62857 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS28P62857 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS28P62857 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS28P62857 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS28P62857 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS28P62857 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS28P62857 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RPS28P62857 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS28P62857 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS28P62857 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS28P62857 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS28P62857 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS28P62857 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS28P62857 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS28P62857 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS28P62857 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS28P62857 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS28P62857 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS28P62857 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS28P62857 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS28P62857 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS28P62857 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RPS28P62857 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS28P62857 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS28P62857 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS28P62857 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS28P62857 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS28P62857 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS28P62857 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS28P62857 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS28P62857 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS28P62857 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS28P62857 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RPS28P62857 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RPS28P62857 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RPS28P62857 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RPS28P62857 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RPS28P62857 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPS28P62857 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPS28P62857 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPS28P62857 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPS28P62857 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPS28P62857 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPS28P62857 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPS28P62857 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RPS28P62857 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms