Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOBP62745 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOBP62745 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOBP62745 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOBP62745 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOBP62745 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOBP62745 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOBP62745 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOBP62745 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOBP62745 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOBP62745 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOBP62745 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOBP62745 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOBP62745 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOBP62745 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOBP62745 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOBP62745 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOBP62745 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOBP62745 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOBP62745 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOBP62745 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOBP62745 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOBP62745 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOBP62745 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOBP62745 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOBP62745 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOBP62745 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOBP62745 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOBP62745 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOBP62745 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOBP62745 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOBP62745 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOBP62745 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOBP62745 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOBP62745 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOBP62745 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOBP62745 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOBP62745 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOBP62745 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOBP62745 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOBP62745 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOBP62745 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOBP62745 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOBP62745 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOBP62745 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOBP62745 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOBP62745 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOBP62745 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOBP62745 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHOBP62745 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOBP62745 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOBP62745 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOBP62745 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOBP62745 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOBP62745 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOBP62745 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOBP62745 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOBP62745 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOBP62745 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHOBP62745 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOBP62745 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOBP62745 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOBP62745 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOBP62745 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOBP62745 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHOBP62745 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHOBP62745 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOBP62745 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOBP62745 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOBP62745 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOBP62745 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOBP62745 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOBP62745 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOBP62745 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOBP62745 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOBP62745 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOBP62745 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms