Protein–RNA interactions for Protein: P62424

RPL7A, 60S ribosomal protein L7a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL7AP62424 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL7AP62424 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms