Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFM1P61960 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFM1P61960 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFM1P61960 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFM1P61960 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFM1P61960 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFM1P61960 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFM1P61960 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFM1P61960 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UFM1P61960 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFM1P61960 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFM1P61960 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UFM1P61960 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFM1P61960 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFM1P61960 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFM1P61960 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFM1P61960 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFM1P61960 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFM1P61960 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFM1P61960 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFM1P61960 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFM1P61960 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UFM1P61960 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UFM1P61960 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UFM1P61960 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UFM1P61960 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFM1P61960 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFM1P61960 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UFM1P61960 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFM1P61960 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFM1P61960 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFM1P61960 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFM1P61960 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFM1P61960 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFM1P61960 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFM1P61960 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFM1P61960 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFM1P61960 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFM1P61960 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFM1P61960 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFM1P61960 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFM1P61960 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFM1P61960 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFM1P61960 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UFM1P61960 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFM1P61960 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFM1P61960 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFM1P61960 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UFM1P61960 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFM1P61960 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFM1P61960 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFM1P61960 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFM1P61960 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFM1P61960 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UFM1P61960 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFM1P61960 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFM1P61960 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFM1P61960 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFM1P61960 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFM1P61960 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UFM1P61960 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFM1P61960 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFM1P61960 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFM1P61960 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFM1P61960 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UFM1P61960 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFM1P61960 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFM1P61960 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFM1P61960 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFM1P61960 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFM1P61960 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFM1P61960 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFM1P61960 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFM1P61960 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFM1P61960 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFM1P61960 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFM1P61960 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFM1P61960 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFM1P61960 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFM1P61960 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFM1P61960 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UFM1P61960 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UFM1P61960 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UFM1P61960 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UFM1P61960 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UFM1P61960 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UFM1P61960 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UFM1P61960 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UFM1P61960 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UFM1P61960 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UFM1P61960 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UFM1P61960 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UFM1P61960 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UFM1P61960 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UFM1P61960 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFM1P61960 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFM1P61960 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFM1P61960 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFM1P61960 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UFM1P61960 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms