Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00315P59091 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00315P59091 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00315P59091 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms