Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP4BP1P59074 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms