Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CABP4P57796 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CABP4P57796 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CABP4P57796 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CABP4P57796 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CABP4P57796 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CABP4P57796 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CABP4P57796 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CABP4P57796 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CABP4P57796 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CABP4P57796 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CABP4P57796 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CABP4P57796 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CABP4P57796 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CABP4P57796 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CABP4P57796 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CABP4P57796 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CABP4P57796 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CABP4P57796 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CABP4P57796 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CABP4P57796 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CABP4P57796 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CABP4P57796 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CABP4P57796 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CABP4P57796 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CABP4P57796 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CABP4P57796 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CABP4P57796 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CABP4P57796 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CABP4P57796 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CABP4P57796 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CABP4P57796 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CABP4P57796 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CABP4P57796 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CABP4P57796 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CABP4P57796 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CABP4P57796 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CABP4P57796 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CABP4P57796 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CABP4P57796 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP4P57796 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP4P57796 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP4P57796 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP4P57796 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP4P57796 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP4P57796 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP4P57796 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP4P57796 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP4P57796 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP4P57796 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP4P57796 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CABP4P57796 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP4P57796 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP4P57796 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP4P57796 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP4P57796 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP4P57796 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP4P57796 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CABP4P57796 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CABP4P57796 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CABP4P57796 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CABP4P57796 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CABP4P57796 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CABP4P57796 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CABP4P57796 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CABP4P57796 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CABP4P57796 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CABP4P57796 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CABP4P57796 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CABP4P57796 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CABP4P57796 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP4P57796 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP4P57796 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP4P57796 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CABP4P57796 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CABP4P57796 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CABP4P57796 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP4P57796 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP4P57796 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP4P57796 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP4P57796 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP4P57796 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP4P57796 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CABP4P57796 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP4P57796 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP4P57796 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CABP4P57796 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP4P57796 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP4P57796 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP4P57796 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP4P57796 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP4P57796 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP4P57796 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP4P57796 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP4P57796 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP4P57796 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP4P57796 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP4P57796 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CABP4P57796 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CABP4P57796 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms