Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRG3P56975 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRG3P56975 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRG3P56975 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRG3P56975 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRG3P56975 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRG3P56975 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRG3P56975 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRG3P56975 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRG3P56975 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRG3P56975 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRG3P56975 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRG3P56975 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRG3P56975 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRG3P56975 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRG3P56975 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRG3P56975 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRG3P56975 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRG3P56975 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRG3P56975 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRG3P56975 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRG3P56975 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRG3P56975 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRG3P56975 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRG3P56975 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRG3P56975 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRG3P56975 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRG3P56975 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRG3P56975 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRG3P56975 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NRG3P56975 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRG3P56975 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRG3P56975 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRG3P56975 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRG3P56975 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRG3P56975 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRG3P56975 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRG3P56975 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRG3P56975 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRG3P56975 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRG3P56975 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRG3P56975 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRG3P56975 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRG3P56975 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NRG3P56975 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRG3P56975 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NRG3P56975 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRG3P56975 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRG3P56975 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRG3P56975 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NRG3P56975 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NRG3P56975 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NRG3P56975 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NRG3P56975 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRG3P56975 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRG3P56975 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NRG3P56975 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRG3P56975 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NRG3P56975 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRG3P56975 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRG3P56975 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRG3P56975 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRG3P56975 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NRG3P56975 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NRG3P56975 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NRG3P56975 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NRG3P56975 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRG3P56975 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NRG3P56975 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRG3P56975 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NRG3P56975 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRG3P56975 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRG3P56975 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NRG3P56975 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRG3P56975 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRG3P56975 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRG3P56975 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NRG3P56975 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NRG3P56975 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRG3P56975 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRG3P56975 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRG3P56975 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NRG3P56975 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NRG3P56975 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRG3P56975 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRG3P56975 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRG3P56975 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NRG3P56975 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRG3P56975 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NRG3P56975 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRG3P56975 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NRG3P56975 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NRG3P56975 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NRG3P56975 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NRG3P56975 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRG3P56975 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NRG3P56975 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NRG3P56975 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRG3P56975 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRG3P56975 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms