Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPD52P55327 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPD52P55327 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPD52P55327 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPD52P55327 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52P55327 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52P55327 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52P55327 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52P55327 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52P55327 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52P55327 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52P55327 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52P55327 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPD52P55327 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52P55327 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52P55327 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52P55327 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52P55327 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52P55327 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52P55327 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52P55327 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52P55327 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52P55327 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52P55327 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52P55327 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPD52P55327 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52P55327 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52P55327 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52P55327 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52P55327 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52P55327 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52P55327 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52P55327 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52P55327 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52P55327 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52P55327 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52P55327 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52P55327 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52P55327 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52P55327 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPD52P55327 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPD52P55327 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPD52P55327 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TPD52P55327 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPD52P55327 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPD52P55327 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPD52P55327 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPD52P55327 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPD52P55327 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPD52P55327 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPD52P55327 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPD52P55327 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPD52P55327 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TPD52P55327 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPD52P55327 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPD52P55327 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPD52P55327 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPD52P55327 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPD52P55327 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPD52P55327 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPD52P55327 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPD52P55327 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPD52P55327 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPD52P55327 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPD52P55327 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPD52P55327 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPD52P55327 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPD52P55327 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPD52P55327 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPD52P55327 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPD52P55327 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPD52P55327 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPD52P55327 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPD52P55327 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPD52P55327 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52P55327 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52P55327 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52P55327 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52P55327 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52P55327 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52P55327 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52P55327 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52P55327 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52P55327 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52P55327 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52P55327 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52P55327 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52P55327 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52P55327 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPD52P55327 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPD52P55327 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPD52P55327 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPD52P55327 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPD52P55327 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPD52P55327 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPD52P55327 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPD52P55327 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPD52P55327 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPD52P55327 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPD52P55327 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms