Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP9P55211 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP9P55211 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP9P55211 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP9P55211 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP9P55211 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP9P55211 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP9P55211 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP9P55211 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP9P55211 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP9P55211 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP9P55211 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP9P55211 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP9P55211 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP9P55211 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP9P55211 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP9P55211 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP9P55211 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP9P55211 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP9P55211 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP9P55211 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP9P55211 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP9P55211 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP9P55211 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP9P55211 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP9P55211 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP9P55211 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP9P55211 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP9P55211 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP9P55211 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP9P55211 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP9P55211 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP9P55211 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP9P55211 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP9P55211 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP9P55211 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP9P55211 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP9P55211 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP9P55211 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP9P55211 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP9P55211 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP9P55211 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP9P55211 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP9P55211 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP9P55211 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP9P55211 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP9P55211 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP9P55211 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP9P55211 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP9P55211 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP9P55211 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP9P55211 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP9P55211 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP9P55211 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP9P55211 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP9P55211 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP9P55211 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP9P55211 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP9P55211 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP9P55211 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP9P55211 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP9P55211 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP9P55211 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP9P55211 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP9P55211 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP9P55211 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP9P55211 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP9P55211 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP9P55211 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP9P55211 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP9P55211 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP9P55211 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP9P55211 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP9P55211 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP9P55211 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP9P55211 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP9P55211 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP9P55211 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP9P55211 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP9P55211 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP9P55211 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP9P55211 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP9P55211 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP9P55211 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP9P55211 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP9P55211 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP9P55211 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP9P55211 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP9P55211 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP9P55211 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP9P55211 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP9P55211 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP9P55211 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP9P55211 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP9P55211 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP9P55211 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP9P55211 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP9P55211 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP9P55211 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP9P55211 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms