Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHA4P54764 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHA4P54764 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA4P54764 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms