Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D1P54289 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D1P54289 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D1P54289 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms