Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 GMH1YKR030W 822 nt7.49□□□□□ -1.21
SSK2P53599 PHO87YCR037C 2772 nt7.48□□□□□ -1.21
SSK2P53599 CTR3YLR411W 726 nt7.48□□□□□ -1.21
SSK2P53599 GSY1YFR015C 2127 nt7.48□□□□□ -1.21
SSK2P53599 RSC6YCR052W 1452 nt7.47□□□□□ -1.21
SSK2P53599 NOG2YNR053C 1461 nt7.47□□□□□ -1.21
SSK2P53599 GDH2YDL215C 3279 nt7.47□□□□□ -1.21
SSK2P53599 SPG4YMR107W 348 nt7.46□□□□□ -1.21
SSK2P53599 TRS33YOR115C 807 nt7.46□□□□□ -1.21
SSK2P53599 KAR2YJL034W 2049 nt7.46□□□□□ -1.22
SSK2P53599 SNA2YDR525W-A 240 nt7.46□□□□□ -1.22
SSK2P53599 APM2YHL019C 1818 nt7.45□□□□□ -1.22
SSK2P53599 SFB3YHR098C 2790 nt7.45□□□□□ -1.22
SSK2P53599 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt7.45□□□□□ -1.22
SSK2P53599 DCD1YHR144C 939 nt7.45□□□□□ -1.22
SSK2P53599 SFT2YBL102W 648 nt7.45□□□□□ -1.22
SSK2P53599 GSY2YLR258W 2118 nt7.45□□□□□ -1.22
SSK2P53599 TNA1YGR260W 1605 nt7.44□□□□□ -1.22
SSK2P53599 API2YDR525W 330 nt7.44□□□□□ -1.22
SSK2P53599 FRA2YGL220W 363 nt7.44□□□□□ -1.22
SSK2P53599 MTF1YMR228W 1026 nt7.44□□□□□ -1.22
SSK2P53599 LYP1YNL268W 1836 nt7.44□□□□□ -1.22
SSK2P53599 GCN20YFR009W 2259 nt7.44□□□□□ -1.22
SSK2P53599 YCR023CYCR023C 1836 nt7.43□□□□□ -1.22
SSK2P53599 YIL055CYIL055C 1884 nt7.43□□□□□ -1.22
SSK2P53599 YOR379CYOR379C 339 nt7.43□□□□□ -1.22
SSK2P53599 PHM7YOL084W 2976 nt7.42□□□□□ -1.22
SSK2P53599 RXT3YDL076C 885 nt7.42□□□□□ -1.22
SSK2P53599 HST4YDR191W 1113 nt7.42□□□□□ -1.22
SSK2P53599 YKL223WYKL223W 333 nt7.42□□□□□ -1.22
SSK2P53599 snR10snR10 245 nt7.42□□□□□ -1.22
SSK2P53599 RGT1YKL038W 3513 nt7.42□□□□□ -1.22
SSK2P53599 KGD1YIL125W 3045 nt7.42□□□□□ -1.22
SSK2P53599 MET12YPL023C 1974 nt7.42□□□□□ -1.22
SSK2P53599 MPH2YDL247W 1830 nt7.42□□□□□ -1.22
SSK2P53599 MAS1YLR163C 1389 nt7.42□□□□□ -1.22
SSK2P53599 UBX7YBR273C 1311 nt7.42□□□□□ -1.22
SSK2P53599 EPS1YIL005W 2106 nt7.41□□□□□ -1.22
SSK2P53599 CMK2YOL016C 1344 nt7.41□□□□□ -1.22
SSK2P53599 RCR2YDR003W 633 nt7.41□□□□□ -1.22
SSK2P53599 TAF11YML015C 1041 nt7.41□□□□□ -1.22
SSK2P53599 LOS1YKL205W 3303 nt7.41□□□□□ -1.22
SSK2P53599 MAL13YGR288W 1422 nt7.4□□□□□ -1.22
SSK2P53599 MCM2YBL023C 2607 nt7.4□□□□□ -1.22
SSK2P53599 OXP1YKL215C 3861 nt7.4□□□□□ -1.22
SSK2P53599 AIM7YDR063W 450 nt7.4□□□□□ -1.22
SSK2P53599 NMD3YHR170W 1557 nt7.39□□□□□ -1.23
SSK2P53599 KCC4YCL024W 3114 nt7.39□□□□□ -1.23
SSK2P53599 YCR085WYCR085W 354 nt7.39□□□□□ -1.23
SSK2P53599 CPR4YCR069W 957 nt7.38□□□□□ -1.23
SSK2P53599 HMS2YJR147W 1077 nt7.38□□□□□ -1.23
SSK2P53599 RSA4YCR072C 1548 nt7.38□□□□□ -1.23
SSK2P53599 COA3YJL062W-A 258 nt7.37□□□□□ -1.23
SSK2P53599 MCM6YGL201C 3054 nt7.37□□□□□ -1.23
SSK2P53599 POR1YNL055C 852 nt7.37□□□□□ -1.23
SSK2P53599 SIA1YOR137C 1869 nt7.37□□□□□ -1.23
SSK2P53599 SOL1YNR034W 966 nt7.36□□□□□ -1.23
SSK2P53599 PDX3YBR035C 687 nt7.36□□□□□ -1.23
SSK2P53599 ASN2YGR124W 1719 nt7.35□□□□□ -1.23
SSK2P53599 BIT2YBR270C 1638 nt7.35□□□□□ -1.23
SSK2P53599 MID2YLR332W 1131 nt7.34□□□□□ -1.23
SSK2P53599 YMD8YML038C 1329 nt7.34□□□□□ -1.23
SSK2P53599 QCR2YPR191W 1107 nt7.33□□□□□ -1.24
SSK2P53599 RSC2YLR357W 2670 nt7.33□□□□□ -1.24
SSK2P53599 IMD3YLR432W 1572 nt7.33□□□□□ -1.24
SSK2P53599 ARC1YGL105W 1131 nt7.33□□□□□ -1.24
SSK2P53599 YCR061WYCR061W 1896 nt7.32□□□□□ -1.24
SSK2P53599 THS1YIL078W 2205 nt7.32□□□□□ -1.24
SSK2P53599 MHF2YDL160C-A 243 nt7.32□□□□□ -1.24
SSK2P53599 FAT3YKL187C 2253 nt7.31□□□□□ -1.24
SSK2P53599 SUL2YLR092W 2682 nt7.31□□□□□ -1.24
SSK2P53599 CPS1YJL172W 1731 nt7.31□□□□□ -1.24
SSK2P53599 PDR18YNR070W 4002 nt7.31□□□□□ -1.24
SSK2P53599 TFG1YGR186W 2208 nt7.3□□□□□ -1.24
SSK2P53599 ARH1YDR376W 1482 nt7.29□□□□□ -1.24
SSK2P53599 RPC53YDL150W 1269 nt7.29□□□□□ -1.24
SSK2P53599 SSB2YNL209W 1842 nt7.28□□□□□ -1.24
SSK2P53599 YJL215CYJL215C 360 nt7.28□□□□□ -1.24
SSK2P53599 AKL1YBR059C 3327 nt7.28□□□□□ -1.24
SSK2P53599 CWH43YCR017C 2862 nt7.27□□□□□ -1.25
SSK2P53599 PCT1YGR202C 1275 nt7.27□□□□□ -1.25
SSK2P53599 RPL43BYJR094W-A 279 nt7.26□□□□□ -1.25
SSK2P53599 HES1YOR237W 1305 nt7.26□□□□□ -1.25
SSK2P53599 RMD9YGL107C 1941 nt7.26□□□□□ -1.25
SSK2P53599 RCK2YLR248W 1833 nt7.26□□□□□ -1.25
SSK2P53599 VID27YNL212W 2349 nt7.25□□□□□ -1.25
SSK2P53599 TPK1YJL164C 1194 nt7.25□□□□□ -1.25
SSK2P53599 SNF8YPL002C 702 nt7.25□□□□□ -1.25
SSK2P53599 MSC2YDR205W 2175 nt7.25□□□□□ -1.25
SSK2P53599 ELP2YGR200C 2367 nt7.25□□□□□ -1.25
SSK2P53599 YEL077CYEL077C 3834 nt7.25□□□□□ -1.25
SSK2P53599 YDL032WYDL032W 312 nt7.25□□□□□ -1.25
SSK2P53599 IRC22YEL001C 678 nt7.25□□□□□ -1.25
SSK2P53599 RPS4BYHR203C 786 nt7.25□□□□□ -1.25
SSK2P53599 YIL165CYIL165C 360 nt7.25□□□□□ -1.25
SSK2P53599 RPS4AYJR145C 786 nt7.25□□□□□ -1.25
SSK2P53599 NCS6YGL211W 1080 nt7.24□□□□□ -1.25
SSK2P53599 NTA1YJR062C 1374 nt7.24□□□□□ -1.25
SSK2P53599 TRM11YOL124C 1302 nt7.23□□□□□ -1.25
SSK2P53599 STE20YHL007C 2820 nt7.22□□□□□ -1.25
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