Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms