Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST2P52849 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST2P52849 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST2P52849 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST2P52849 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST2P52849 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST2P52849 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST2P52849 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDST2P52849 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDST2P52849 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDST2P52849 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDST2P52849 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDST2P52849 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDST2P52849 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST2P52849 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST2P52849 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST2P52849 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST2P52849 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST2P52849 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST2P52849 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST2P52849 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST2P52849 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST2P52849 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST2P52849 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST2P52849 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST2P52849 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST2P52849 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST2P52849 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST2P52849 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST2P52849 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST2P52849 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST2P52849 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST2P52849 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST2P52849 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST2P52849 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST2P52849 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST2P52849 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST2P52849 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST2P52849 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST2P52849 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST2P52849 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST2P52849 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST2P52849 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST2P52849 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST2P52849 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST2P52849 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST2P52849 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST2P52849 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST2P52849 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST2P52849 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST2P52849 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST2P52849 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST2P52849 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST2P52849 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST2P52849 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST2P52849 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST2P52849 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST2P52849 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST2P52849 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST2P52849 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST2P52849 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST2P52849 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST2P52849 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST2P52849 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST2P52849 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST2P52849 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST2P52849 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST2P52849 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST2P52849 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST2P52849 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST2P52849 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST2P52849 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST2P52849 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST2P52849 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST2P52849 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST2P52849 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST2P52849 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST2P52849 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST2P52849 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDST2P52849 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST2P52849 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST2P52849 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST2P52849 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST2P52849 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST2P52849 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST2P52849 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST2P52849 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST2P52849 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST2P52849 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST2P52849 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NDST2P52849 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST2P52849 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST2P52849 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST2P52849 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST2P52849 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST2P52849 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST2P52849 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST2P52849 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST2P52849 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDST2P52849 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms