Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF140P52738 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF140P52738 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms