Protein–RNA interactions for Protein: P51685

CCR8, C-C chemokine receptor type 8, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR8P51685 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR8P51685 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR8P51685 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR8P51685 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR8P51685 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR8P51685 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR8P51685 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR8P51685 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR8P51685 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR8P51685 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR8P51685 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR8P51685 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR8P51685 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR8P51685 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR8P51685 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR8P51685 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR8P51685 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR8P51685 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR8P51685 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR8P51685 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR8P51685 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR8P51685 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR8P51685 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR8P51685 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR8P51685 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR8P51685 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR8P51685 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR8P51685 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR8P51685 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR8P51685 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR8P51685 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR8P51685 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR8P51685 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR8P51685 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR8P51685 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR8P51685 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR8P51685 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR8P51685 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR8P51685 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR8P51685 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR8P51685 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR8P51685 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR8P51685 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR8P51685 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR8P51685 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR8P51685 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR8P51685 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR8P51685 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR8P51685 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR8P51685 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR8P51685 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR8P51685 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR8P51685 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR8P51685 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR8P51685 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR8P51685 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR8P51685 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR8P51685 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR8P51685 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR8P51685 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR8P51685 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR8P51685 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR8P51685 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR8P51685 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR8P51685 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR8P51685 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR8P51685 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR8P51685 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR8P51685 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR8P51685 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR8P51685 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR8P51685 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR8P51685 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR8P51685 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR8P51685 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR8P51685 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR8P51685 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR8P51685 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR8P51685 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR8P51685 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR8P51685 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR8P51685 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR8P51685 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR8P51685 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR8P51685 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR8P51685 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR8P51685 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR8P51685 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR8P51685 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR8P51685 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR8P51685 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR8P51685 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCR8P51685 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR8P51685 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR8P51685 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR8P51685 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR8P51685 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR8P51685 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR8P51685 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR8P51685 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms