Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRIP1P50238 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms