Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF6P49848 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF6P49848 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF6P49848 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF6P49848 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF6P49848 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF6P49848 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF6P49848 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF6P49848 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF6P49848 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF6P49848 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF6P49848 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF6P49848 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF6P49848 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF6P49848 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF6P49848 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF6P49848 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF6P49848 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF6P49848 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF6P49848 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF6P49848 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF6P49848 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF6P49848 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF6P49848 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF6P49848 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF6P49848 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF6P49848 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF6P49848 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF6P49848 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF6P49848 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF6P49848 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF6P49848 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF6P49848 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF6P49848 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF6P49848 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF6P49848 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF6P49848 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF6P49848 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF6P49848 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF6P49848 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF6P49848 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF6P49848 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF6P49848 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF6P49848 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF6P49848 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF6P49848 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF6P49848 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF6P49848 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF6P49848 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF6P49848 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF6P49848 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF6P49848 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF6P49848 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF6P49848 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF6P49848 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF6P49848 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF6P49848 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF6P49848 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF6P49848 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF6P49848 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF6P49848 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF6P49848 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF6P49848 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF6P49848 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF6P49848 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF6P49848 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF6P49848 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF6P49848 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF6P49848 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF6P49848 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF6P49848 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF6P49848 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF6P49848 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF6P49848 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF6P49848 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF6P49848 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF6P49848 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF6P49848 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF6P49848 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF6P49848 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF6P49848 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF6P49848 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF6P49848 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF6P49848 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF6P49848 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF6P49848 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF6P49848 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF6P49848 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF6P49848 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF6P49848 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF6P49848 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF6P49848 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF6P49848 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF6P49848 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF6P49848 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF6P49848 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF6P49848 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF6P49848 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF6P49848 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF6P49848 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms