Protein–RNA interactions for Protein: P49756

RBM25, RNA-binding protein 25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM25P49756 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM25P49756 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM25P49756 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM25P49756 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM25P49756 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM25P49756 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM25P49756 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM25P49756 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM25P49756 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM25P49756 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM25P49756 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM25P49756 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM25P49756 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM25P49756 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM25P49756 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM25P49756 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM25P49756 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM25P49756 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM25P49756 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM25P49756 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM25P49756 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM25P49756 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM25P49756 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM25P49756 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM25P49756 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM25P49756 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM25P49756 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM25P49756 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM25P49756 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM25P49756 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM25P49756 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM25P49756 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM25P49756 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM25P49756 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM25P49756 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM25P49756 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM25P49756 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM25P49756 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM25P49756 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM25P49756 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM25P49756 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM25P49756 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM25P49756 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM25P49756 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM25P49756 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM25P49756 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM25P49756 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM25P49756 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBM25P49756 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM25P49756 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM25P49756 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM25P49756 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM25P49756 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM25P49756 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM25P49756 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM25P49756 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM25P49756 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM25P49756 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM25P49756 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM25P49756 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM25P49756 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM25P49756 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM25P49756 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM25P49756 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM25P49756 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM25P49756 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM25P49756 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM25P49756 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM25P49756 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM25P49756 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM25P49756 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM25P49756 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM25P49756 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM25P49756 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM25P49756 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM25P49756 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM25P49756 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM25P49756 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM25P49756 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM25P49756 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM25P49756 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM25P49756 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM25P49756 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM25P49756 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM25P49756 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM25P49756 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM25P49756 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM25P49756 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM25P49756 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM25P49756 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM25P49756 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM25P49756 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM25P49756 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM25P49756 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM25P49756 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM25P49756 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM25P49756 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM25P49756 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RBM25P49756 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBM25P49756 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms