Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT3P49368 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT3P49368 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT3P49368 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT3P49368 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT3P49368 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT3P49368 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT3P49368 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCT3P49368 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT3P49368 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT3P49368 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT3P49368 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT3P49368 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCT3P49368 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT3P49368 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT3P49368 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT3P49368 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT3P49368 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT3P49368 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT3P49368 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT3P49368 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT3P49368 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT3P49368 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT3P49368 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT3P49368 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT3P49368 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT3P49368 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT3P49368 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT3P49368 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT3P49368 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT3P49368 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT3P49368 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT3P49368 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT3P49368 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT3P49368 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT3P49368 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT3P49368 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT3P49368 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT3P49368 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT3P49368 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT3P49368 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT3P49368 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT3P49368 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT3P49368 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT3P49368 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT3P49368 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT3P49368 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT3P49368 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT3P49368 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT3P49368 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT3P49368 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT3P49368 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT3P49368 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT3P49368 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT3P49368 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT3P49368 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT3P49368 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT3P49368 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT3P49368 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT3P49368 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT3P49368 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT3P49368 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT3P49368 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT3P49368 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT3P49368 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT3P49368 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT3P49368 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT3P49368 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT3P49368 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT3P49368 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT3P49368 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT3P49368 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT3P49368 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT3P49368 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT3P49368 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT3P49368 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT3P49368 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT3P49368 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT3P49368 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT3P49368 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT3P49368 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT3P49368 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT3P49368 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT3P49368 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT3P49368 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT3P49368 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT3P49368 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT3P49368 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT3P49368 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT3P49368 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT3P49368 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT3P49368 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT3P49368 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT3P49368 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT3P49368 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT3P49368 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT3P49368 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT3P49368 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT3P49368 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT3P49368 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms