Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRGP48443 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RXRGP48443 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRGP48443 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRGP48443 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRGP48443 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRGP48443 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRGP48443 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRGP48443 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRGP48443 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RXRGP48443 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRGP48443 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRGP48443 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRGP48443 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRGP48443 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRGP48443 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRGP48443 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRGP48443 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRGP48443 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RXRGP48443 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RXRGP48443 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RXRGP48443 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RXRGP48443 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RXRGP48443 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RXRGP48443 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RXRGP48443 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RXRGP48443 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RXRGP48443 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RXRGP48443 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RXRGP48443 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RXRGP48443 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RXRGP48443 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RXRGP48443 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RXRGP48443 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RXRGP48443 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RXRGP48443 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RXRGP48443 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RXRGP48443 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RXRGP48443 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RXRGP48443 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RXRGP48443 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RXRGP48443 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RXRGP48443 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RXRGP48443 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RXRGP48443 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RXRGP48443 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RXRGP48443 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RXRGP48443 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RXRGP48443 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RXRGP48443 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RXRGP48443 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RXRGP48443 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RXRGP48443 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RXRGP48443 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RXRGP48443 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RXRGP48443 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RXRGP48443 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RXRGP48443 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RXRGP48443 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RXRGP48443 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RXRGP48443 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RXRGP48443 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRGP48443 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRGP48443 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRGP48443 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRGP48443 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRGP48443 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRGP48443 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RXRGP48443 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRGP48443 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRGP48443 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RXRGP48443 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RXRGP48443 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RXRGP48443 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RXRGP48443 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRGP48443 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRGP48443 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRGP48443 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRGP48443 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRGP48443 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRGP48443 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RXRGP48443 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRGP48443 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRGP48443 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRGP48443 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRGP48443 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRGP48443 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRGP48443 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRGP48443 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRGP48443 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRGP48443 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRGP48443 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRGP48443 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRGP48443 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRGP48443 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RXRGP48443 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRGP48443 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRGP48443 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRGP48443 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRGP48443 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms