Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA2P48052 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA2P48052 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA2P48052 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA2P48052 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA2P48052 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA2P48052 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA2P48052 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA2P48052 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA2P48052 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA2P48052 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPA2P48052 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CPA2P48052 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA2P48052 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA2P48052 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA2P48052 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA2P48052 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA2P48052 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPA2P48052 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA2P48052 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA2P48052 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA2P48052 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPA2P48052 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA2P48052 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA2P48052 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA2P48052 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA2P48052 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA2P48052 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA2P48052 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA2P48052 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA2P48052 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPA2P48052 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA2P48052 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA2P48052 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA2P48052 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA2P48052 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA2P48052 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA2P48052 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA2P48052 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA2P48052 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA2P48052 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA2P48052 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA2P48052 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA2P48052 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA2P48052 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA2P48052 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA2P48052 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA2P48052 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA2P48052 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA2P48052 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA2P48052 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA2P48052 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA2P48052 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA2P48052 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA2P48052 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA2P48052 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA2P48052 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA2P48052 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA2P48052 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA2P48052 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA2P48052 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA2P48052 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA2P48052 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA2P48052 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA2P48052 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA2P48052 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA2P48052 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA2P48052 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA2P48052 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA2P48052 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA2P48052 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA2P48052 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA2P48052 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA2P48052 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA2P48052 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA2P48052 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA2P48052 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA2P48052 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA2P48052 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA2P48052 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA2P48052 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA2P48052 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA2P48052 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA2P48052 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA2P48052 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA2P48052 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA2P48052 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA2P48052 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA2P48052 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA2P48052 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA2P48052 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA2P48052 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA2P48052 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA2P48052 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA2P48052 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA2P48052 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA2P48052 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA2P48052 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA2P48052 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA2P48052 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms