Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNJ1P48048 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNJ1P48048 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms