Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS9P46781 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS9P46781 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS9P46781 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS9P46781 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS9P46781 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS9P46781 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS9P46781 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS9P46781 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS9P46781 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS9P46781 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS9P46781 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS9P46781 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS9P46781 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS9P46781 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS9P46781 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS9P46781 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS9P46781 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS9P46781 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS9P46781 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS9P46781 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS9P46781 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS9P46781 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS9P46781 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS9P46781 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS9P46781 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS9P46781 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS9P46781 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS9P46781 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS9P46781 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS9P46781 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS9P46781 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS9P46781 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS9P46781 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS9P46781 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS9P46781 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS9P46781 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS9P46781 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS9P46781 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS9P46781 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS9P46781 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS9P46781 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS9P46781 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS9P46781 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS9P46781 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS9P46781 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS9P46781 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS9P46781 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS9P46781 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS9P46781 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS9P46781 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS9P46781 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS9P46781 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS9P46781 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS9P46781 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS9P46781 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS9P46781 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS9P46781 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS9P46781 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS9P46781 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS9P46781 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS9P46781 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS9P46781 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS9P46781 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS9P46781 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS9P46781 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS9P46781 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS9P46781 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS9P46781 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS9P46781 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS9P46781 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS9P46781 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS9P46781 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS9P46781 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS9P46781 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS9P46781 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS9P46781 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS9P46781 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS9P46781 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS9P46781 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS9P46781 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS9P46781 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS9P46781 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS9P46781 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS9P46781 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS9P46781 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS9P46781 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS9P46781 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS9P46781 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS9P46781 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS9P46781 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS9P46781 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS9P46781 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS9P46781 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS9P46781 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS9P46781 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS9P46781 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS9P46781 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS9P46781 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS9P46781 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms