Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ATRXP46100 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATRXP46100 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRXP46100 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRXP46100 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRXP46100 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATRXP46100 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATRXP46100 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATRXP46100 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATRXP46100 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATRXP46100 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATRXP46100 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATRXP46100 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATRXP46100 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATRXP46100 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATRXP46100 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRXP46100 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATRXP46100 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRXP46100 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATRXP46100 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATRXP46100 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATRXP46100 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATRXP46100 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRXP46100 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRXP46100 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRXP46100 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRXP46100 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRXP46100 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRXP46100 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATRXP46100 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATRXP46100 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATRXP46100 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRXP46100 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATRXP46100 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATRXP46100 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRXP46100 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRXP46100 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRXP46100 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRXP46100 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRXP46100 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRXP46100 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRXP46100 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATRXP46100 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATRXP46100 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ATRXP46100 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATRXP46100 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATRXP46100 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATRXP46100 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATRXP46100 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRXP46100 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRXP46100 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRXP46100 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRXP46100 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRXP46100 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRXP46100 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRXP46100 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRXP46100 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRXP46100 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRXP46100 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRXP46100 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRXP46100 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRXP46100 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRXP46100 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRXP46100 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRXP46100 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRXP46100 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRXP46100 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRXP46100 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRXP46100 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRXP46100 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRXP46100 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRXP46100 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRXP46100 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRXP46100 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRXP46100 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRXP46100 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRXP46100 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRXP46100 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRXP46100 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRXP46100 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRXP46100 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRXP46100 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRXP46100 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRXP46100 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRXP46100 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRXP46100 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRXP46100 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRXP46100 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRXP46100 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRXP46100 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRXP46100 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRXP46100 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRXP46100 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRXP46100 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRXP46100 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRXP46100 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRXP46100 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRXP46100 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRXP46100 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRXP46100 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms