Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX2-1P43699 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX2-1P43699 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms