Protein–RNA interactions for Protein: P35520

CBS, Cystathionine beta-synthase, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSP35520 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBSP35520 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBSP35520 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBSP35520 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBSP35520 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBSP35520 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CBSP35520 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBSP35520 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBSP35520 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBSP35520 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBSP35520 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBSP35520 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBSP35520 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBSP35520 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBSP35520 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBSP35520 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBSP35520 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBSP35520 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBSP35520 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBSP35520 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBSP35520 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBSP35520 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBSP35520 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBSP35520 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBSP35520 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBSP35520 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBSP35520 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBSP35520 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBSP35520 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBSP35520 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBSP35520 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBSP35520 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBSP35520 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBSP35520 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBSP35520 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBSP35520 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBSP35520 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBSP35520 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBSP35520 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBSP35520 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBSP35520 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBSP35520 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBSP35520 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBSP35520 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBSP35520 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBSP35520 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBSP35520 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBSP35520 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBSP35520 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBSP35520 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBSP35520 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBSP35520 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBSP35520 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBSP35520 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBSP35520 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CBSP35520 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBSP35520 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CBSP35520 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBSP35520 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBSP35520 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBSP35520 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBSP35520 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBSP35520 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBSP35520 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CBSP35520 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBSP35520 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBSP35520 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBSP35520 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBSP35520 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBSP35520 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBSP35520 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBSP35520 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBSP35520 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBSP35520 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBSP35520 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBSP35520 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBSP35520 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBSP35520 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBSP35520 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBSP35520 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBSP35520 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBSP35520 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBSP35520 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBSP35520 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBSP35520 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBSP35520 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBSP35520 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBSP35520 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CBSP35520 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CBSP35520 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CBSP35520 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBSP35520 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBSP35520 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBSP35520 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBSP35520 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBSP35520 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBSP35520 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBSP35520 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBSP35520 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBSP35520 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms