Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORAP35398 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORAP35398 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORAP35398 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORAP35398 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORAP35398 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RORAP35398 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORAP35398 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORAP35398 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORAP35398 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RORAP35398 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORAP35398 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORAP35398 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORAP35398 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORAP35398 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RORAP35398 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORAP35398 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORAP35398 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORAP35398 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORAP35398 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORAP35398 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORAP35398 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORAP35398 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORAP35398 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORAP35398 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORAP35398 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RORAP35398 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORAP35398 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORAP35398 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORAP35398 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORAP35398 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORAP35398 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RORAP35398 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RORAP35398 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RORAP35398 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RORAP35398 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RORAP35398 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RORAP35398 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RORAP35398 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORAP35398 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORAP35398 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORAP35398 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORAP35398 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORAP35398 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RORAP35398 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORAP35398 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORAP35398 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORAP35398 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORAP35398 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORAP35398 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RORAP35398 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORAP35398 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORAP35398 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORAP35398 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORAP35398 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORAP35398 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORAP35398 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORAP35398 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORAP35398 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORAP35398 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORAP35398 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORAP35398 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORAP35398 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORAP35398 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORAP35398 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORAP35398 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORAP35398 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORAP35398 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORAP35398 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORAP35398 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORAP35398 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORAP35398 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORAP35398 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORAP35398 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORAP35398 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORAP35398 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORAP35398 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORAP35398 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RORAP35398 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORAP35398 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORAP35398 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORAP35398 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORAP35398 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORAP35398 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORAP35398 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RORAP35398 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RORAP35398 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RORAP35398 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RORAP35398 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RORAP35398 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RORAP35398 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RORAP35398 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RORAP35398 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RORAP35398 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
RORAP35398 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RORAP35398 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RORAP35398 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RORAP35398 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RORAP35398 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RORAP35398 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms