Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA4P35212 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA4P35212 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA4P35212 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA4P35212 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA4P35212 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA4P35212 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA4P35212 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA4P35212 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA4P35212 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA4P35212 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA4P35212 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA4P35212 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA4P35212 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA4P35212 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA4P35212 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA4P35212 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA4P35212 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA4P35212 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA4P35212 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA4P35212 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA4P35212 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA4P35212 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA4P35212 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA4P35212 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA4P35212 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA4P35212 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA4P35212 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA4P35212 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA4P35212 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA4P35212 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA4P35212 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA4P35212 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA4P35212 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA4P35212 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA4P35212 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA4P35212 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA4P35212 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA4P35212 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA4P35212 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA4P35212 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA4P35212 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA4P35212 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA4P35212 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA4P35212 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA4P35212 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA4P35212 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA4P35212 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA4P35212 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA4P35212 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA4P35212 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA4P35212 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA4P35212 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA4P35212 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA4P35212 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA4P35212 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA4P35212 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA4P35212 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA4P35212 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA4P35212 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA4P35212 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA4P35212 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA4P35212 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA4P35212 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA4P35212 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA4P35212 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA4P35212 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA4P35212 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA4P35212 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA4P35212 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA4P35212 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA4P35212 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA4P35212 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA4P35212 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA4P35212 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA4P35212 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA4P35212 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA4P35212 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA4P35212 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA4P35212 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA4P35212 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJA4P35212 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA4P35212 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA4P35212 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA4P35212 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA4P35212 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA4P35212 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA4P35212 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA4P35212 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GJA4P35212 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA4P35212 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA4P35212 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA4P35212 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA4P35212 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA4P35212 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA4P35212 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA4P35212 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA4P35212 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA4P35212 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA4P35212 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms