Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCD1P33897 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCD1P33897 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCD1P33897 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms