Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP2P32456 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP2P32456 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP2P32456 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP2P32456 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP2P32456 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP2P32456 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP2P32456 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP2P32456 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP2P32456 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP2P32456 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP2P32456 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP2P32456 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP2P32456 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP2P32456 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP2P32456 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP2P32456 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP2P32456 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP2P32456 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP2P32456 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP2P32456 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP2P32456 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP2P32456 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP2P32456 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP2P32456 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP2P32456 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP2P32456 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP2P32456 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP2P32456 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP2P32456 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP2P32456 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP2P32456 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP2P32456 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP2P32456 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP2P32456 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP2P32456 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP2P32456 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP2P32456 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP2P32456 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP2P32456 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP2P32456 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP2P32456 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP2P32456 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP2P32456 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP2P32456 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP2P32456 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP2P32456 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP2P32456 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP2P32456 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP2P32456 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP2P32456 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP2P32456 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP2P32456 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP2P32456 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP2P32456 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP2P32456 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP2P32456 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP2P32456 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP2P32456 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP2P32456 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP2P32456 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP2P32456 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP2P32456 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP2P32456 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP2P32456 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP2P32456 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP2P32456 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP2P32456 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP2P32456 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP2P32456 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP2P32456 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP2P32456 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP2P32456 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP2P32456 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP2P32456 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP2P32456 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP2P32456 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP2P32456 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GBP2P32456 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP2P32456 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP2P32456 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP2P32456 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP2P32456 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP2P32456 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP2P32456 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP2P32456 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP2P32456 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP2P32456 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP2P32456 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP2P32456 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP2P32456 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP2P32456 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP2P32456 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP2P32456 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP2P32456 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP2P32456 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP2P32456 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP2P32456 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP2P32456 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP2P32456 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms