Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA9P31269 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA9P31269 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms