Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXA7P31268 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
HOXA7P31268 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXA7P31268 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms